• 全身性自己免疫疾患
  • 関節リウマチ（RA）
  • 全身性エリテマトーデス（SLE）
  • 抗リン脂質抗体症候群（APS）
  • 全身性強皮症（SSc）
  • 多発性筋炎/皮膚筋炎（PM/DM）
  • 混合性結合組織病（MCTD）
  • シェーグレン症候群（SS）
  • 血管炎症候群
  • 顕微鏡的多発血管炎（MPA）
  • 多発血管炎性肉芽腫症（GPA）
  • 好酸球性多発血管炎性肉芽腫症（EGPA）
  • 抗糸球体基底膜腎炎
  • 急速進行性糸球体腎炎（RPGN）
  • ベーチェット病
  • 成人スチル病
  • 強直性脊椎炎
• 臓器特異的自己免疫疾患
  • 自己免疫性肝炎（AIH）
  • 原発性胆汁性胆管炎（PBC）
  • 天疱瘡
  • 類天疱瘡（後天性表皮水疱症を含む）
  • 慢性甲状腺炎（橋本病）
  • バセドウ病
  • 潰瘍性大腸炎（UC）
  • クローン病（CD）
  • 特発性血小板減少性紫斑病（ITP）
  • 自己免疫性肺胞蛋白症（PAP）

全身性強皮症（Systemic sclerosis; SSc）は，皮膚硬化が前腕や躯幹にまで及ぶびまん皮膚硬化型全身性強皮症（diffuse cutaneous SSc; dcSSc）と，手指，顔面に限局する限局皮膚硬化型全身性強皮症（limited cutaneous SSc; lcSSc）に分けられます．また，前者では抗Scl-70抗体（抗トポイソメラーゼI抗体），抗RNAポリメラーゼⅢ抗体が，後者では抗セントロメア抗体が出現することから，これらの自己抗体の測定は病型の分類に有意義です．

皮膚症状：　手指腫脹，皮膚硬化，色素沈着と脱失
末梢循環障害：　レイノー現象，手指潰瘍
臓器障害：　肺動脈性肺高血圧症，心筋障害，消化管機能障害，間質性肺疾患，腎クリーゼ