• 全身性自己免疫疾患
  • 関節リウマチ（RA）
  • 全身性エリテマトーデス（SLE）
  • 抗リン脂質抗体症候群（APS）
  • 全身性強皮症（SSc）
  • 多発性筋炎/皮膚筋炎（PM/DM）
  • 混合性結合組織病（MCTD）
  • シェーグレン症候群（SS）
  • 血管炎症候群
  • 顕微鏡的多発血管炎（MPA）
  • 多発血管炎性肉芽腫症（GPA）
  • 好酸球性多発血管炎性肉芽腫症（EGPA）
  • 抗糸球体基底膜腎炎
  • 急速進行性糸球体腎炎（RPGN）
  • ベーチェット病
  • 成人スチル病
  • 強直性脊椎炎
• 臓器特異的自己免疫疾患
  • 自己免疫性肝炎（AIH）
  • 原発性胆汁性胆管炎（PBC）
  • 天疱瘡
  • 類天疱瘡（後天性表皮水疱症を含む）
  • 慢性甲状腺炎（橋本病）
  • バセドウ病
  • 潰瘍性大腸炎（UC）
  • クローン病（CD）
  • 特発性血小板減少性紫斑病（ITP）
  • 自己免疫性肺胞蛋白症（PAP）

顕微鏡的多発血管炎（Microscopic polyangiitis; MPA）は，主として小型血管（毛細血管，細静脈，細動脈）を侵す壊死性血管炎で，免疫沈着はみられないか，わずかにしかみられません．小動脈や中型動脈を侵す壊死性血管炎がみられることもあります．壊死性糸球体腎炎は非常に高頻度にみられます．肺毛細血管炎がしばしば起きます．肉芽腫性炎症はみられません．
抗好中球細胞質抗体（ANCA）は蛍光染色パターンで細胞質全体が染色される細胞質型C-ANCAと，核周辺が強く染色される核周囲型P-ANCAに分類され，P-ANCAに属する，ミエロペルオキシダーゼに対する自己抗体（MPO-ANCA）は，MPAで高率に検出されます．